Située dans le canton de Chalamont, la commune de Saint-Nizier-le-Désert tient son nom d'un des plus illustres évêques de Lyon : Nizier. Elle comporte quelques hameaux : les Basset, les Carrys, les Mallet ou les Grimadières mais la plupart des habitations sont isolées dans la campagne. C'est ... 
Située dans le canton de Chalamont, la commune de Saint-Nizier-le-Désert tient son nom d'un des plus illustres évêques de Lyon : Nizier. Elle comporte quelques hameaux : les Basset, les Carrys, les Mallet ou les Grimadières mais la plupart des habitations sont isolées dans la campagne.
C'est probablement au XIème siècle que le village naît, autour de l'église actuelle, comme beaucoup d'autres en France à la suite du défrichement résultant de la forte croissance démographique depuis l'an 1000. Par ailleurs une population était déjà implantée autour du prieuré de Montfavrey qui jouxte le village.
La première appellation de la commune est « Saint-Nizier » en dessous du Montfavrey (Sanctua Nicecius apud Montem Fabrosum). Elle devient « Saint-Nizier dans le Désert » en 1276, « Saint-Nizier-en-Bresse », « Désert Défriché » en 1789 sous la Révolution, en raison de son apparence comme une terre inculte et inondée.
Au début du XIIIème siècle, la seigneurie de Saint-Nizier-le-Désert dépend directement du domaine des sires de Beaujeu. En 1276, Louis de Beaujeu en concède la justice à Guillaume de Juys qui est à l'origine de la construction du château de Belvey à Dompierre-sur-Veyle. Elle est rachetée en 1290 par Guillaume de Verfey, puîné de la famille de Chalamont.
En 1402, Humbert VII, dernier sire de Thoire-Villars, sans enfants et très endetté, vend ses terres. Une partie va aux Bourbons et l'autre à Amédée VIII de Savoie. La frontière traverse la commune. L'église et le château de la Veyze sont en Bresse savoyarde, propriété de la famille de Savoie.
Parmi les lieux notables de la commune, on peut citer :
- - l'église Saint-Nizier, construite au XIème siècle, est caractérisée par une travée de choeur typiquement romane classée à l'inventaire des monuments historiques. Le plafond de la travée a été modifié au XVIIème siècle après la destruction du clocher par la foudre. Des aménagements ont eu lieu au XIXème siècle. Durant ces travaux, le perron de l'église a été remanié et deux pierres tombales ont été réemployées. On peut ainsi lire sur l'une « Ci-gît Henry Félix Passerat, négociant à Lyon, né à Oyonnax le 28 juillet 1786, décédé le 3 7bre 1841 ». En 2001, l'extérieur de l'église a été restauré mettant en valeur le matériau de galets d'origine. Le monument aux morts a été déplacé.
- - le château de la Veyse [ou Vèze ou Vaise] : ruiné en 1595, il est reconstruit au XVIIIème siècle.
Liste des maires, établie d’après les registres des délibérations et le Dictionnaire des hommes et femmes politiques de l’Ain de 1789 à 2011 par Dominique Saint-Pierre, 2e édition, 2011 et complétée par les dossiers d’élections municipales. Les mentions « démissionnaire » et « décédé » indiquent que le maire a démissionné ou est décédé en cours de mandat.
- Pierre Décher, né en 1748 (1790-1792)
- Pierre Mallet, né en 1744 (cité en 1792-1800)
- Jean Bonnamant, né vers 1758 (1800-1806 ; décédé)
- Claude Bérard, député du Tiers-État de la commune en 1790 (1806-1819 ; décédé)
- Michel Antoine Gally, géomètre au Cadastre de l’Ain (1819-1825 ; démissionnaire)
- Isaac Toullieux (1825-1853 ; démissionnaire)
- Jacques Frémion, né en 1812, propriétaire (1853-1856 ; démissionnaire)
- Jean Joseph Milliet, né en 1823, propriétaire (1856-1870)
- Mathieu Fayet (août -septembre 1870)
- Joannès (Jean Marie Benoit) Orsel, né en 1832, rentier (septembre 1870-1874)
- Jean Joseph Milliet, né en 1823, propriétaire (1874-1875) : en 1875, le président de la République dissout le conseil municipal de Saint-Nizier-le-Désert.
- Joannès (Jean Marie Benoit) Orsel, né en 1832, rentier (1875-1882)
- Joseph Montbarbon, né en 1823 (1882-1884 ; décédé)
- Antoine Rombaud6 (1884-1904)
- Pierre Joseph Foncelas, né en 1858, cultivateur (1904-1908)
- Jean Baconnier (1908-1919) : mobilisé pendant la guerre, l’intérim est assuré par Denis Jolivet.
- Claude Chaussat, né en 1872, cultivateur (1919-1925) : Denis Jolivet est élu mais refuse la fonction.
- Denis Jolivet, né en 1874, cultivateur (1925-1926)
- Pierre Dupont (1926-1933) : Jean Baconnier est élu mais refuse la fonction.
- Michel Rivet, né en 1898 (1933-1944) : à partir d’août 1941, convocation d’une délégation spéciale et non du conseil municipal, maire déchu de ses droits civiques en 1944
- Marius Revel, président du comité communal de libération (1944-1973)
- Georges Baillivy (1973-1978)
- André Grépelut, né en 1939, agriculteur (1978-1983)
- Lucien Guillot, cultivateur (1983-1989)
- André Grépelut, né en 1939, agriculteur (1989-2004)
- Jean-Yves Barbet (2004-2008)
- Françoise Bernillon, né en 1940, principale de collège et proviseure de lycée (2008-2020)
- Jean-Paul Courrier, né en 1957, ancien cadre (depuis 2020)
